La praxis de investigación en el CIISDER se sustenta en los 29 años de existencia, así como en 28 generaciones de egresados de la Maestría en Análisis Regional con sus respectivas tesis de los egresados; la Primera generación del Docturado en Estudios Territoriales (DET) y sus proyectos de investigación. El ejercicio metodológico aplicado, fortalece tanto el trabajo científico de los profesores como de los estudiantes de la Maestría y del Doctorado en Estudios Territoriales.
La producción del conocimiento científico a través de Proyectos de investigación, financiados y sin financiamiento, contribuyen en ampliar productos académico-científicos, libros, capítulos de libros, Artículos en revistas indexadas, Artículos de divulgación; por otra parte, la divulgación de la ciencia en congresos al interior de la UATx, así como nacionales e internacionales, a través de ponencias que se someten a evaluación y crítica por pares académicos de otras instituciones.
El trabajo en el CIISDER, está comprometido en que la ciencia social tenga un uso y aplicación teórico -práctica para contribuir en la atención y solución de la problemática que en la actualidad vive la humanidad.